"Invisibles" haben nicht nur auf einem Webserver eine spezielle Bedeutung, sondern auch auf deinem Entwicklungs-Mac. Du merkst es spätestens dann, wenn du eine .htaccess-Datei aus deinem Code-Editor abspeichern möchtest.
Warnhinweis beim Abspeichern aus BBEdit (englisch)
Warnhinweis beim Abspeichern aus Visual Studio Code (deutsch)
Wenn du die "Invisibles" im Finder eingeblendet hast (s.o.), kannst du den Dialog mit dem blauen Button bestätigen, denn du weisst ja, das das nichts Schlimmes bedeutet.
Auch beim Verschieben von .htaccess-Dateien geschieht manchmal Unerwartetes. Ich habe schon diese Meldung zu Gesicht bekommen:

Ich versuchte, eine zip-Datei mit einer .htaccess-Datei von einem anderem Entwickler bei mir zu entpacken und in einem Projekt von mir zu verwenden. Offenbar bestehen auf dem Mac besondere Sicherheitsvorkehrungen für solche Dateien.
Leider kann ich dir keinen Workarround zu diesem Problem anbieten.